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Mongo Management Studio unterscheidet drei Arten von Abfragen. Die "Find"-Abfrage, Abfragen mittels Aggregation Framework und serverseitige Script Abfragen, bei der die Befehle über die db.command() Funktion des MongoDB node.js Treibers ausgeführt werden. Den jeweiligen Modus kann man über die Symbolleiste innerhalb eines Tabs einstellen. Dabei hat jeder Modus seine eigene Eingabemaske.. Beim Wechseln zwischen den Modi bleiben die Eingaben erhalten, die Abfrage wird aber nicht automatisch gestartet.

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