Basierend auf der MongoDB-Treiberversion 2.4 wird mit dieser Funktionalität die ausgewählte Datenbank auf mögliche Fehler und inkonsistente Datenspeicherung geprüft und diese notfalls behoben. Des Weiteren werden alle Indizes innerhalb der Datenbank neu erstellt.
Um diese Funktion auszuführen, muss man mit der rechten Maustaste auf den Datenbanknamen in der linken Bildschirmhälfte klicken und "Reparieren" auswählen.